COVID-19 変異株に関する最新情報

2024年9月17日現在、SARS-CoV-2オミクロン変異株KP.2、KP.2.3、KP.3、KP.3.1.1、およびLB.1は米国で高い蔓延を示しています。CDCナウキャスト予測CDC Nowcast projectionsでは、KP.3.1.1 が米国における COVID-19 の新規感染者の約 53% を占めると推定されています。9 月 17 日現在、KP.2.3 による感染者の推定割合は 12.2% (前4 週間からわずかに減少)、LB.1 による感染者の推定割合は 10.0% (これも前4 週間からわずかに減少) です。

上の写真は、米国におけるKP.2、KP.3、LB.1、KP.3.1.1、およびその他のオミクロン株の最近の出現を示す図です。米国における変異体の割合の経時的、地理的、系統的変化を示す追加のインフォグラフィックについては、CDCのCOVIDデータトラッカーをご覧ください。

新型コロナウイルスの大変異と小変異による流行

新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)の変異は、大きく「大変異(macro-mutations)」と「小変異(micro-mutations)」に分けられます。

新型コロナウイルスの進化

オミクロン株の変異は、「小変異」の繰り返し季節性インフルエンザと同じ。

変異体の命名法

いくつかの新しい変異体には、スパイクタンパク質の重要な部位の変異に応じて特定の名前が付けられています。いわゆる「FLip」変異体は、XBBのバックボーンの部位455でFがLに、部位456でLがFに変異しています。1.5「SLip」と呼ばれる別の株も出現しており、これはJN.1スパイクタンパク質の部位456のLがFに変異している。「SLip」の「S」は、JN.1を特徴付ける部位455のSがLに変異していることを指している。最後に、「FLiRT」変異体は、位置456のLがFに、位置346のTがRに変異していることからこのように名付けられています。出現した株KP.2、KP.3、LB.1 はすべて「FLiRT」変異体のファミリーに属すると考えられており、これには KP.2.3 や KP.3.1.1 などの子孫も含まれます。

いくつかのFLiRT変異体は欠失を示す(S:S31del)KP.2およびKP.3に存在する置換に加えて、LB.1などのこの欠失を伴う変異体は、「deFLiRTこれは、この変異体が、この追加の欠失を伴う他の FLiRT 変異体と同じ変異を有することを示しています。

SARS-CoV-2およびオミクロン特異的抗体の血清陽性率

非常に高い割合(>95%)現在、感染、免疫、またはその両方の組み合わせにより、SARS-CoV-2に対する抗体を保有している人の割合は、オランダでの粘膜免疫の調査を目的とした研究では、個人の鼻腔サンプル中に非常に高い(95%)スパイク特異的IgGも特定されました。

米国の既存の研究では、大幅な増加が示唆されているSARS-CoV-2抗体の血清陽性率はオミクロン以前からオミクロン時代にかけて全年齢層で増加し、2022年第3四半期までに、16歳以上の人の約3分の2がSARS-CoV-2に感染し、そのうち約半数がハイブリッド免疫を獲得したと予測されています。

KP.3.1.1特有の免疫と伝染性

KP.3.1.1 変異体は KP.3 変異体 (JN.1 の子孫) の子孫であり、ワクチンによる免疫防御からの逃避に関連するいくつかの変異が含まれています。予備的な証拠 (まだ査読されていません) によると、出現した KP.3.1.1 変異体は KP.3 と比較して感染力が高く、回復期血清中の KP.3.1.1 に対する 50% 中和力価は KP.3 よりも大幅に低い可能性があります。追加の証拠(まだ査読されていません) KP.3.1.1 は JN.1 に比べて感染性が高く、JN.1 に比べて中和抗体の誘発が減少するという調査結果を裏付けています。

その他のKP.2およびKP.3特異的免疫および伝染性

KP.2変異体(JN.1.11.1.2とも呼ばれる)はJN.1変異体の子孫であり、ワクチンによる免疫防御からの逃避に関連するいくつかの変異を含む。予備調査では、KP.2 (Re) の推定相対有効再生産数は、JN.1 の Re より 1.22 倍高い可能性がある。追加の変異体である KP.3は、KP.2 と同様のウイルス学的および疫学的特性を持つと考えられている。3 つ目の出現変異体である LB.1 も FLiRT変異体である。

予備調査の結果、KP.2 および KP.3 のウイルス適応度は、以前の JN.1 変異体および亜変異体よりも高いことが示唆されていますが、本研究の疑似ウイルスアッセイでは、KP.2 の感染性は JN.1 の 10.5 倍低い可能性があることが示唆されました。重要な点は、ウイルス中和アッセイにおいて、KP.2 は単価XBB.1.5 (最新の COVID-19 ワクチン) でワクチン接種を受けた人の血清に対してかなりの耐性を示したことです。ただし、KP.2 と JN.1 の抗原類似性が高いため、最近 JN.1 に感染した人は、KP.2 に対して何らかの交差中和抗体防御を持っている可能性が高いと予想されます。

LB.1特異的免疫と伝染性

KP.2やKP.3と同様に、LB.1はJN.1変異体の子孫である。しかし、KP.2やKP.3とは異なり、LB.1には追加の変異が見られる。(S:S31del) に加えて、KP.2 および KP.3 に存在する置換により、これらが「FLiRT」変異体として指定されます。

モデリング研究の予備結果東京大学の研究グループによる、まだ査読されていない論文では、LB.1 の相対的有効再生産数 (Reff) が KP.2 や KP.3 よりも高い可能性があることが示されています。追加の亜種である KP.2.3 は、LB.1と同じ変異 (S:S31del) を示しています。同じ研究で、KP.2 や KP.3 と比較して、より高い相対的 Reff も示されました。

この研究では、XBB.1.5、EG.5、HK.3、JN.1 感染のブレイクスルー感染血清と、感染未経験の一価 XBB.1.5 ワクチン接種血清を使用した中和試験も実施しました。4 つの血清グループすべてにおいて、LB.1 と KP.2.3 は、JN.1 と KP.2 と比較して 50% 中和力価が低いことがわかりました。重要な点は、感染未経験の XBB.1.5 ワクチン接種血清は、JN.1 亜種に対する中和力価が非常に低く、KP.3、LB.1、KP.2.3 の力価は JN.1 と比較して低かったことです。

これらの結果を総合すると、最新のCOVID-19ワクチンの接種を受けた人であっても、オミクロンの新たな変異体に感染する可能性が高いことが示唆されます。LB.1とKP.2.3は、KP.2とKP.3よりも感染性が高く、免疫回避能力も高いようです。

JN.1特異的免疫と伝染性

JN.1型はオミクロン型BA.2.86の亜型である。 ワクチンによる免疫防御からの逃避に関連するいくつかの変異が含まれています。出現した変異体 KP.2、KP.3、および LB.1 は JN.1 から派生したものです。

JN.1変異体は抗原的に異なるXBB.1.5変異株は、現在、一価COVID-19ワクチンの標的となっている。最近の研究では、JN.1は免疫回避に非常に効果的であり(他のオミクロン変異株よりもさらに効果的)、その結果、繁殖数が増加することが明らかになっている。小規模な血清学的研究からの証拠少なくともSARS-CoV-2ワクチンの完全な初回接種を受けた若年成人では、他のBA.2.86ウイルスと比較して、JN.1変異体に対するSARS-CoV-2に対する血清学的防御力が低下していることが示唆されている。さらに、最近の血清学的調査では、1,472人の地域在住者を対象とした調査では、感染歴のある人の大多数がJN.1に対する中和活性を持つ抗体を持っていたものの、その中和能力は他のSARS-CoV-2株に対する中和能力に比べて比較的低かったことがわかった。これらの知見は、追加の 抗原地図作成によって裏付けられている。分析これは、XBB.1.5ブースター血清がXBB亜系統変異体(JN.1を含む)を中和する能力があったにもかかわらず、5倍の力価差が依然として観察されたことを示しています。

JN.1 は確かに伝染力が強いようですが、他の SARS-CoV-2 変異体よりも重篤な疾患を引き起こすことはないようです。

ワクチンと現在のSARS-CoV-2変異株

ワクチン接種は依然として重症COVID-19の予防に有効であり、最新のSARS-CoV-2ワクチンによるワクチン接種では、JN.1とその子孫を認識できる抗体が生成されます。

研究により、JN.1は耐性があることが判明した。単価XBB.1.5ワクチン血清に対して、データはまた、JN.1がT細胞の認識を完全に逃れる可能性は低い。最近の報告ではBA.2.86やJN.1を含むいくつかのオミクロン亜種に対する二価(祖先株とBA.4/BA.5)ワクチンによって誘発される中和抗体は、元の一価ワクチンと比較して大幅に高いことが確認されている。現在のワクチン誘発抗体のKP.2およびKP.3株に対する中和能力を推定する証拠は非常に限られている。しかし、予備的な証拠はKP.2とKP.3(および他の関連するFLiRT変異体)は、追加の 免疫回避能力JN.1を超える; さらに予備的な証拠(まだ査読されていない) は、出現している変異体LB.1 および KP.2.3 が、KP.2 およびKP.3 が示すものを超える追加の免疫回避を示す可能性があることを示唆しています。

JN.1によって引き起こされる可能性のある疾患に対するワクチンの有効性の予備的な推定は、米国で最近JN.1が出現し、それに代わるFLiRT変異体が急速に増加したため、不正確である。予備的な推定では、JN.1に対するVEはまだかなり大きい(VE:49%、95%信頼区間:19%〜68%)ことを示唆しているが、VE推定値はJN.1以外の疾患に対する推定値(VE:60%、95%信頼区間:35%〜75%)よりも低い。JN.1に対するXBB.1.5ワクチンの有効性に関するこれらの米国ベースの推定値は、オランダのデータを使用した最近のプレプリントからの予備推定値(18〜59歳で41%、60〜85歳で50%)。しかし、JN.1特異的ワクチンの有効性の推定値は、 大規模なワクチン有効性研究でより低かった。クリーブランドクリニックの従業員の19%(VE)です。KP.2、KP.3、LB.1に対する現在のワクチンの有効性を推定する証拠は非常に限られています。しかし、これらの新興変異株に対する現在のワクチンの有効性は、JN.1に対するものよりも低い可能性があります。 最近の研究(まだ査読されていない)で特定されたこれらの変異体が示す追加の免疫回避特性を考慮すると。

これらの要因を総合的に考慮し、予防接種実施諮問委員会は、2024年2月下旬までに65歳以上の人は2024年春には、COVID-19ワクチンのさらなる改良版が開発される予定だ。さらに、FDAのワクチン・生物学的製剤諮問委員会は、CDCの予防接種実施に関する諮問委員会(ACIP)は2024年6月に、2024年秋冬から2025年冬にかけてのCOVID-19ワクチンは、JN.1特異的抗原を含む一価ワクチンであるべきだと推奨しました。

治療薬:パクスロビドは引き続き効果を発揮している。

パクスロビドはプロテアーゼ阻害剤であり、その作用機序はSARS-CoV-2ウイルスのスパイクタンパク質とは関係のない部分が関与している。 そのため、SARS-CoV-2変異体のスパイクタンパク質へのさらなる潜在的な変化は、Paxlovidの有効性に影響を与えない。

このページのトップに戻る